Alternative Splicing Tool

Verktyget analyserar alternativ splejsning genom att läsa in isoform-antal eller transkript-abundanser över prover. Det beräknar PSI-värden för exoninnehållande händelser och levererar händelsebaserade mått som avslöjar isoformanvändningsmönster.
Konceptuellt bygger det på en standard inklusions/exklusionsmodell, stödjer flerisomera händelser, normalisering och art-specifika annoteringar. Det kan jämföra villkor för att identifiera differentialt splejsning med delta PSI och enkla heuristiker, medan reproducerbara arbetsflöden behålls.
Mottagare inkluderar molekylärbiologer, beräkningsbiologer och laboratorier som utför RNA-seq-analys eller transkriptom-studier. Värdet ligger i transparenta beräkningar, auditerbara pipelines och exportbara rapporter som passar för vidare analyser. Kernfunktioner inkluderar PSI-beräkning, händelse-rapporter, händelsefiltrering, provmetadata-hantering och export i CSV/JSON. Användningsfall täcker vävnadsspecifik splejsning, behandlingssvar och isoform- switch-undersökningar; verktyget betonar robust validering och tydliga antaganden.