Alternative Splicing Tool

De tool analyseert alternatieve splicing door isoform-counts of transcript-abundances over monsters in te lezen. Het berekent PSI-waarden voor exon-inclusie-gevallen en levert per-gebeurtenis metriek die isoform-gebruikspatronen onthult.
Conceptueel is de tool gebaseerd op een standaard inclusie/exclusie-model, ondersteunt multi-isoform-gevallen, normalisatie en soortspecifieke annotaties. Het kan voorwaarden vergelijken om differentieel splicing te identificeren met delta PSI en eenvoudige heuristieken, waarbij reproduceerbare workflows behouden blijven.
Beoogde gebruikers zijn moleculaire biologen, computationele biologen en laboratoria die RNA-seq-analyses of transcriptomiekstudies uitvoeren. De unieke waarde ligt in transparante berekeningen, auditbare pipelines en exporteerbare rapporten die geschikt zijn voor downstream analyses. Kernfuncties omvatten PSI-berekening, per-actie-rapporten, gebeurtenisfiltering, verwerkingen van monster-metadonnées en export in CSV/JSON. Toepassingen variëren van weefsel-specifiek splicing tot behandelingsrespons en isoform-switch-onderzoeken; de tool benadrukt robuuste validatie en duidelijke aannames.