Alternative Splicing Tool

Das Tool analysiert alternatives Spleißen, indem es Isoform-Counts oder Transkript-Abundanzen über Proben hinweg einliest. Es berechnet PSI-Werte für Exon-Inklusionsereignisse und liefert ereignisbezogene Metriken, die Muster der Isoform-Verwendung zeigen.
Konzeptionell basiert es auf einem Standard-Inklusions/Exklusions-Modell, unterstützt Multi-Isoform-Ereignisse, Normalisierung und spezies­spezifische Annotationen. Es kann Bedingungen vergleichen, um differenziertes Spleißen mit Delta-PSI und einfachen Heuristiken zu identifizieren, während reproduzierbare Workflows gewahrt bleiben.
Nutzer sind Molekularbiologen, Computational Biologists und Labore, die RNA-seq-Analysen oder Transkriptom-Studien durchführen. Der einzigartige Wert liegt in transparenten Berechnungen, auditierbaren Pipelines und exportierbaren Berichten, die sich für nachgelagerte Analysen eignen. Kernfunktionen umfassen PSI-Berechnung, Ereignisberichte, Ereignis-Filterung, Proben-Metadaten-Verarbeitung und Export in CSV/JSON. Anwendungsfälle reichen von tissue-spezifischem Spleißen, Behandlungsergebnissen bis zu Isoform-Wechsel-Untersuchungen; das Tool betont robuste Validierung und klare Annahmen.