Alternative Splicing Tool

A ferramenta analisa o splicing alternativo lendo contagens de isoformas ou abundâncias de transcritos entre amostras. Calcula valores de PSI para eventos de inclusão de éxons e fornece métricas por evento que revelam padrões de uso de isoformas.
Conceitualmente, a ferramenta se baseia em um modelo padrão de inclusão/exclusão, suporta eventos multi-isoforma, normalização e anotações específicas da espécie. Pode comparar condições para identificar splicing diferencial com delta PSI e heurísticas simples, mantendo fluxos de trabalho reprodutíveis.
Os beneficiários incluem biólogos moleculares, biólogos computacionais e laboratórios que realizam análises de RNA-seq ou estudos de transcriptômica. O valor reside em cálculos transparentes, pipelines auditáveis e relatórios exportáveis compatíveis com análises subsequentes. Funções principais: cálculo de PSI, relatórios por evento, filtragem de eventos, manejo de metadados de amostras e exportação em CSV/JSON. Casos de uso: splicing específico de tecido, resposta a tratamentos e investigações de mudança de isoformas; a ferramenta enfatiza validação robusta e suposições claras.