Alternative Splicing Tool

Verktøyet analyserer alternativ spleising ved å lese inn isoform-tellinger eller transkript-abundanser over prøver. Det beregner PSI-verdier for eksjon-inklusjonsbegivenheter og leverer hendelsesbaserte mål som avslører isoform-bruks mønstre.
Kontekstuelt bygger verktøyet på en standard inklusjon/exklusjon-modell, støtter multi-isoform-begivenheter, normalisering og arts-spesifikke annotasjoner. Det kan sammenligne betingelser for å identifisere differential spleising med delta PSI og enkle heuristikker, mens reproduktbare arbeidsflyter beholdes.
Målgruppen er molekylærbiologer, beregningsbiologer og laboratorier som gjennomfører RNA-seq-analyser eller transkriptom-studier. Verdi ligger i transparente beregninger, auditable pipelines og eksportbare rapporter som passer for downstream analyser. Kern funksjoner inkluderer PSI-beregning, hendelsesrapporter, hendelsesfiltrering, prøve-metadatabehandling og eksport i CSV/JSON. Bruksområder dekker vev-spesifikk spleising, behandlingsrespons og isoform-skifte-undersøkelser; verktøyet legger vekt på robust validering og klare antakelser.