Alternative Splicing Tool

הכלי מנתח ספלייסינג חלופי על ידי טעינת ספירות איזופורמים או עשרונות טרנסקריפטים על פני הדגימות. הוא מחשב ערכי PSI לאירועי הכללת אקסון ומפיק מדדים לפי אירוע שמראים דפוסי שימוש באיזופורמים.
מבסס על מודל כללי של כולל/מוציא, תומך באירועים מרובים של איזופורמים, נרמול והערות ספציפיות למין. יכול להשוות תנאים כדי לזהות ספלייסינג דיפרנציאלי עם delta PSI והנחות פשוטות, תוך שמירה על תהליכים שחוזרים.
המשתמשים הם ביולוגים מולקולריים, ביולוגים חישוביים ומעבדות שמבצעות אנליזות RNA-seq או חקר טרנסקריפטומוס. הערך הייחודי הוא בחישובים שקופים, צינורות auditing ודוחות exportable התואמים לניתוחים בהמשך. פונקציות עיקריות כוללות חישוב PSI, דוחות אירועים, סינון אירועים, ניהול מטה-נתוני דגימות וייצוא CSV/JSON. מקרים שימושיים כוללים ספייסינג רקמות, תגובת טיפול וחקר שינויים באיזופורמים; הכלי מדגיש אימות מוצק והנחות ברורות.