Alternative Splicing Tool

Lo strumento analizza lo splicing alternativo leggendo conteggi a livello di isoforma o abundanze di trascritti tra campioni. Calcola i valori PSI per gli eventi di inclusione dell’esone e fornisce metriche per evento che rivelano i pattern di uso delle isoform.
Concettualmente si basa su un modello standard di inclusione/esclusione, supporta eventi multi-isoforma, normalizzazione e annotazioni specifiche della specie. Può confrontare condizioni per identificare splicing differenziale con delta PSI e heuristic semplici, mantenendo flussi di lavoro riproducibili.
I beneficiari includono biologi molecolari, biologi computazionali e laboratori che eseguono analisi RNA-seq o studi sul trascrittomica. Il valore unico risiede in calcoli trasparenti, pipeline auditabili e report esportabili compatibili con analisi downstream. Funzionalità chiave: calcolo PSI, report per evento, filtraggio eventi, gestione metadati campione ed esportazione in CSV/JSON. Casi d’uso: splicing tissutale-specifico, risposta a trattamenti e indagini su switch di isoforma; lo strumento enfatizza validazione robusta e assunzioni chiare.