CGView Server

CGView Server renderar cirkulära genomkartor från sekvensdata och levererar skalbara, publikationsklara visuals för plasmider, bakteriechromosomer och organellgenomer. Det accepterar FASTA- eller GenBank-inmatning och stödjer flera spårtyper såsom gener, GC-innehåll, GC-skew och upprepningar. Rendering-motorn beräknar vinkelskorrdinater från basparpositioner och lägger upp spåren i koncentriska ringar med konfigurerbara radier och färgpallar. I kärnan blir ett enda genomcirkulärt ramverk för annoterade funktioner, där varje funktion mappas till ett bågesegment på det tilldelade spåret. Avancerade användare kan spara och återanvända konfigurationer för att säkerställa reproducerbarhet över experiment. Verktyget är värdefullt för forskare som förbereder figurer för artiklar, forskningsansökningar eller offentliga dataportaler, vilket möjliggör snabb iterering och konsekventa visuella uttryck över projekt. Det betonar deterministisk rendering, stöder SVG-utgång för vektorredigering och erbjuder PNG-export i valda upplösningar för snabba recensioner. Den unika nyttan ligger i kombinationen av genomskala cirkulär layoutlogik, flexibel spåranpassning och publikation-klara exporter i en enda webbgränssnitt, vilket minskar manuell ritning och möjliggör reproducerbar bildgenerering för genomanalyser.