CGView Server

CGView Server genererer sirkulære genomkart fra sekvensdata og leverer skalerbare, publikasjonsklare visuals for plasmider, bakterielle kromosomer og organellegenomer. Den aksepterer FASTA- eller GenBank-innsendelser og støtter flere spor-typer som gener, GC-innhold, GC-skew og gjentakelser. Rendering-motoren beregner vinkelkoordinater ut fra basepar-posisjoner og legger spor i konsentriske ringer med konfigurerbare radier og fargepaletter. I kjernen blir én genom-sirkel referanserammen for annoterte funksjoner, hvor hver funksjon kartlegges til et bue-segment på det angitte sporet. Avanserte brukere kan lagre og gjenbruke konfigurasjoner for å sikre reproducerbarhet på tvers av eksperimenter. Verktøyet er verdifullt for forskere som forbereder figurer til artikler, søknader eller offentlige dataportaler, og muliggjør rask iterasjon og konsistente visuals på tvers av prosjekter. Det legger vekt på deterministisk rendering, støtter SVG-utdata for fre objekter og tilbyr PNG-eksport i valgte oppløsninger for raske gjennomganger. Den unike verdien ligger i kombinasjonen av genom-skala sirkulær layoutlogikk, fleksibel spor-tilpasning og publikasjonsklar eksport i én webgrensesnitt, noe som minimerer manuelt plotting og muliggjør reproducerbar bildegenerering for genom-analyser.