CGView Server

CGView Server rendert kreisförmige Genomkarten aus Sequenzdaten und erzeugt skalierbare, publikationsreife Visualisierungen für Plasmide, bakterielle Chromosomen und organellare Genome. Es akzeptiert FASTA- oder GenBank-Eingaben und unterstützt mehrere Spurtypen wie Gene, GC-Gehalt, GC-Skew und Wiederholungen. Die Rendering-Engine berechnet Winkelkoordinaten aus Basenpaarpositionen und ordnet Spuren in konzentrische Ringe mit konfigurierbaren Radien und Farbpaletten. Im Kern wird ein einzelner Genomkreis zum Referenzrahmen für annotierte Merkmale, wobei jedes Merkmal als Bogensegment auf der vorgesehenen Spur abgebildet wird. Fortgeschrittene Benutzer können Konfigurationen speichern und wiederverwenden, um Reproduzierbarkeit über Experimente hinweg sicherzustellen. Das Tool ist wertvoll für Forscher, die Abbildungen für Papers, Förderanträge oder öffentliche Datenportale vorbereiten, indem es schnelle Iterationen und konsistente Visuals über Projekte hinweg ermöglicht. Es betont deterministische Darstellungen, unterstützt SVG-Ausgabe zur Vektorbearbeitung und bietet PNG-Exporte in auswählbarer Auflösung für schnelle Überprüfungen. Der einzigartige Mehrwert liegt in der Kombination aus genomischer Layout-Logik auf Genomskala, flexibler Track-Anpassung und publikationsfertigen Exporten in einer einzigen Weboberfläche, wodurch manueller Plotting minimiert und reproduzierbare Abbildungen für Genome-Analysen erzeugt werden.