CGView Server

CGView Server מריץ מיפויי גנום מעגליים מתוך נתוני רצף ומספק ויזואליות סקלאבילית ומוכנה לפרסום עבור פלזמידים, כרומוזומים חיידקיים וגנומים אורגנליים. הוא מקבל קלט FASTA או GenBank ותומך במספר סוגי מסלולים כמו גנים, תכולת GC, GC skew וחזרות. מנוע ההדמה מחשב זוויות בהתבסס על מיקומי בזו-בסיס ותוכניות מסלולים בעיגולים concentric עם רדיוסים ופלטות צבעים שניתןConfigure. בליבה, מעגל הגנום الواحد משמש כמסגרת ייחוס לתכונות מתוייגות, שכל תכונה ממומשת ביצירת פאר arc על המסלול המיועד. משתמשים מתקדמים יכולים לשמור ולהשתמש בהגדרות כדי להבטיח שחזוריות. הכלי חשוב לחוקרים שמכינים דמויות למאמרים, הצעות למימון או פורטלי נתונים ציבוריים, ומאפשר חזרה מהירה והופעה עקבית של דימויים בפרויקטים שונים. הוא מדגיש הדמיה דטרמינסטית, תומך ביצוא SVG לעריכה וקטורית ומציע יצואי PNG ברזולוציות לבחירה לצפייה מהירה. ערך ייחודי זהה לשילוב של לוגיקת פריסת מעגלים בגנום, התאמת מסלולים גמישה וייצוא מוכנים לפרסום בתוך ממשק אינטרנט אחד, מה שמקטין ציור ידני ומאפשר יצירת דימויים שניתנים לשחזור עבור ניתוח הגנום.