CGView Server

CGView Server genera mappe circolari del genoma a partire da dati di sequenza e produce visually scalabili e pronti per la pubblicazione per plasmidi, cromosomi batterici e genomi organellari. Accetta input FASTA o GenBank e supporta più tipi di tracce come geni, contenuto GC, GC skew e ripetizioni. Il motore di rendering calcola coordinate angolari dalle posizioni di base e dispone le tracce in anelli concentrici con raggi configurabili e palette di colori. In pratica, un singolo cerchio genomico diventa il riferimento per le caratteristiche annotate, ciascuna caratteristica mappata in un arco sul tracciato designato. Gli utenti avanzati possono salvare e riutilizzare configurazioni per garantire riproducibilità tra esperimenti. lo strumento è utile per ricercatori che preparano figure per articoli, proposte di finanziamento o portali dati pubblici, consentendo iterazioni rapide e visualizzazioni coerenti tra progetti. Sottolinea rendering deterministico, supporta output SVG per modifica vettoriale e offre esportazioni PNG a risoluzioni selezionabili per rapide revisioni. Il valore unico risiede nella combinazione di logica di layout circolare su scala genomica, personalizzazione flessibile delle tracce ed esportazioni pronte per la pubblicazione in un’unica interfaccia web, minimizzando la tracciatura manuale e permettendo generazione di figure riproducibili per analisi genoma.