CGView Server

CGView Server genererer cirkulære genomkort fra sekvensdata og producerer skalerbare, publikationsklare visuals til plasmider, bakterielle kromosomer og organell-genomer. Den accepterer FASTA- eller GenBank-indsendelser og understøtter flere sporbtyper såsom gener, GC-indhold, GC-skew og gentagelser. Rendering-motoren beregner vinkelkoordinater ud fra basepar-positioner og placerer spor i koncentriske ringe med konfigurerbare radii og farvepaletter. Grundlæggende bliver et enkelt genomcirkul et reference-ramme for annoterede funktioner, hvor hver funktion kortlægges til et bue-segment på det tilsvarende spor. Avancerede brugere kan gemme og genbruge konfigurationer for at sikre reproducerbarhed på tværs af eksperimenter. Værktøjet er værdifuldt for forskere, der udarbejder figurer til artikler, ansøgninger eller offentlige dataportaler, og muliggør hurtig iterering og konsistente visuals på tværs af projekter. Det lægger vægt på deterministisk gengivelse, understøtter SVG-udgivelse til vektorbearbejdning og tilbyder PNG-eksport i valgfrie opløsninger til hurtige gennemgange. Den unikke værdi ligger i kombinationen af genomskala cirkulær layoutlogik, fleksibel spordodning og publikationklar eksport i én enkelt webgrænseflade, hvilket minimerer manuel plotting og muliggør reproducerbar billedgenerering af genom-analyser.