CGView Server

CGView Server visualiza mapas circulares del genoma a partir de datos de secuencia para investigadores, permite anotaciones, personalización de colores y exportaciones escalables para visuales listos para publicación.

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Sobre esta herramienta

CGView Server genera mapas génomicos circulares a partir de datos de secuencia y produce visuales escalables y listos para publicación para plásmidos, cromosomas bacterianos y genomas organelares. Acepta entradas FASTA o GenBank y admite múltiples tipos de pistas como genes, contenido GC, sesgo GC y repeticiones. El motor de renderizado calcula coordenadas angulares a partir de posiciones de pares de bases y dispone las pistas en anillos concéntricos con radios y paletas de colores configurables. En esencia, un solo círculo genómico se convierte en el marco de referencia para características anotadas, cada característica mapeada a un segmento de arco en la pista asignada. Los usuarios avanzados pueden guardar y reutilizar configuraciones para garantizar reproducibilidad entre experimentos. La herramienta es valiosa para investigadores que preparan figuras para artículos, propuestas de fondos o portales de datos públicos, permitiendo iteración rápida y visuales consistentes entre proyectos. Enfatiza renderizado determinista, admite salida SVG para edición vectorial y ofrece exportaciones PNG a resoluciones seleccionables para revisiones rápidas. El valor único reside en la combinación de la lógica de diseño circular a escala genómica, la personalización flexible de pistas y exportaciones listas para publicación en una sola interfaz web, minimizando el trazado manual y posibilitando la generación reproducible de imágenes para análisis genómicos.

Cómo usar

Proporcione entradas: cargue un archivo FASTA o GenBank o pegue datos de secuencia; Elegir método: seleccione las pistas a mostrar y establezca paletas de colores; Generar visualización: renderice el mapa genómico circular; Revise resultados: verifique la ubicación de características y ajuste parámetros si es necesario; Exportar: descargue SVG para edición o PNG para compartir rápidamente.

How to use cgview server online tool

Frequently Asked Questions

Encuentre respuestas rápidas

¿Qué formatos de datos son compatibles?
Los formatos de entrada compatibles incluyen FASTA y GenBank; las secuencias pegadas se aceptan si hay anotaciones en formato GenBank. Si faltan anotaciones, se generan pistas predeterminadas para visualizar el contexto básico de la secuencia.
¿Puedo personalizar colores y el orden de las pistas?
Sí. Los usuarios pueden reordenar pistas, activar o desactivar capas específicas (genes, contenido GC, repeticiones) y aplicar paletas de colores o colores hex personalizados a cada pista para un estilo coherente entre figuras.
¿Qué salidas están disponibles?
Las exportaciones incluyen SVG para edición vectorial y PNG a resoluciones seleccionadas. SVG conserva la editabilidad para flujos de trabajo de publicación, mientras que PNG facilita la compartición rápida.
¿Existen límites de longitud de secuencia?
El herramienta soporta plasmidos típicos y genomas bacterianos; genomas muy largos pueden provocar tiempos de renderizado más largos o requerir renderizado por etapas. Espere tiempos de procesamiento mayores para secuencias de varios megabases.

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