CGView Server

CGView Server genereert circulaire genomkaarten vanuit sequentiegegevens en levert schaalbare, publieksklare visuals voor plasmiden, bacteriële chromosomen en organel-genomen. Het accepteert FASTA- of GenBank-invoer en ondersteunt meerdere spoor-types zoals genen, GC-inhoud, GC-skew en herhalingen. De render-engine berekent hoekcoördinaten uit basenparen en plaatst sporen in concentrische ringen met configureerbare stralen en kleurpaletten. In wezen wordt één genomische cirkel het referentiekader voor annotaties, waarbij elk kenmerk wordt toegewezen aan een arc-segment op het aangewezen spoor. Geavanceerde gebruikers kunnen configuraties opslaan en hergebruiken om reproduceerbaarheid over experimenten te waarborgen. De tool is waardevol voor onderzoekers die figuren voorbereiden voor artikelen, subsidiedossiers of openbare dataportalen, waardoor snelle iteraties en consistente visuals over projecten mogelijk zijn. Het legt de nadruk op deterministische weergave, ondersteunt SVG-uitvoer voor vectorbewerkingen en biedt PNG-exporteren in selecteerbare resolies voor snelle beoordelingen. De unieke waarde ligt in de combinatie van genoom-schaal circulaire opmaaklogica, flexibele spoor-aanpassing en publieksklare exports binnen één webinterface, waardoor handmatig plotten wordt verminderd en reproduceerbare figuurgeneratie voor genomische analyses mogelijk is.