IGV Web Tool

IGV Web Tool renderar överensmatchade läsningar, varianter och annotationsspår direkt i webbläsaren. Användare laddar BAM/CRAM, VCF, BED/BigWig‑data för en vald genomsbyggnad och region. Det stöder multi‑spårvy, koordinatbaserade frågor och klientlagrad caching för smidig utforskning. Data flyttas konceptuellt streaming eller öppnas från lokala filer, avkodas och visualiseras som täckningsstaplar, läsarrangemang och variantsmarkörer. Verktyget betonar snabb inspektion, reproducerbarhet och enkel delning av vyer mellan forskare. Värdet ligger i webbläsarens inbyggda drift, stöd för fjärrkällor och lätta exportalternativ för figurer eller konfigurationer. Huvudfunktioner: (1) koordinatnavigering, (2) multi‑spårrendering, (3) grundläggande filtrering efter kvalitet eller alel, (4) lokal och fjärråtkomst, (5) per‑spår konfiguration och färgkodning, (6) export av aktuell vy till JSON eller bild, (7) regionbaserade frågor för snabba kontroller över prover. Användningsfall: QC‑kontroller vid sekvensering, validering av varianter i ett genomiskt intervall och förberedelse av visuella illustrations för rapporter eller publikationer. Verktyget är avsett för forskare, kliniker och data‑chefer som behöver snabb visualisering utan installation och integritet i webbläsaren. Prestanda är optimerad för måttliga datamängder och streaming av segment från fjärrservrar där stöds.