IGV Web Tool

IGV Web Tool renderen geIjste reads, varianten en annotatie‑sporen rechtstreeks in een browser. Gebruikers laden BAM/CRAM, VCF, BED/BigWig‑gegevens voor een gekozen genomische build en regio. Het ondersteunt multi‑track weergave, op coördinaten gebaseerde query's en client‑side caching voor soepele verkenning. Data worden conceptueel gestreamd of geopend uit lokale bestanden, gedecodeerd en gevisualiseerd als dekking‑balken, leeslay-outs en variant‑markers. De tool richt zich op snelle inspectie, reproduceerbaarheid en eenvoudige deling van views tussen onderzoekers. Unieke waarde komt van browser‑native werking, ondersteuning voor externe data sources en lichte exportopties voor figuren of configuraties. Kernfuncties: (1) coördinatennavigatie, (2) multi‑track rendering, (3) basale filtering op kwaliteit of allel, (4) lokale en remote data access, (5) per‑track configuratie en kleurcodering, (6) export van huidige weergave naar JSON of afbeelding, (7) regio‑gebaseerde query’s voor snelle checks over monsters. Toepassingsgevallen: QC‑checks bij sequencing runs, variantenvalidatie in een genomisch interval en het voorbereiden van visuals voor rapporten of publicaties. Het tool is bedoeld voor onderzoekers, klinici en data‑managers die een snelle, installatievrije visualisatie‑ervaring vereisen met privacy in de browser. Prestaties zijn geoptimaliseerd voor gematigde hoeveelheden data en streaming van segmenten van remote servers waar ondersteund.