IGV Web Tool

IGV Web Tool gjengir avstemmede leser, varianter og annotasjons-spor direkte i nettleseren. Brukere laster BAM/CRAM, VCF, BED/BigWig‑data for en valgt genomisk bygging og region. Den støtter fler-spors visning, koordinatbaserte forespørsler og klientside caching for jevn utforskning. Dataene strømmer eller åpnes fra lokale filer, kodes og visualiseres som dekningbar, leseoppsett og variantmarkører. Verktøyet fokuserer på rask inspeksjon, revisjonssikkerhet og enkel deling av visninger mellom forskere. Verdighet ligger i nettleserens innebygde drift, støtte for eksterne datakilder og lette eksportalternativer for figurer eller konfigurasjoner. Hovedfunksjoner: (1) koordinatnavigasjon, (2) multi‑spors rendering, (3) grunnleggende filtrering etter kvalitet eller allel, (4) lokal og fjern dataadgang, (5) per‑spor konfigurasjon og fargekoding, (6) eksport av gjeldende visning som JSON eller bilde, (7) regionbaserte forespørsler for raske kontroller over prøver. Bruksområder inkluderer QC‑kontroller av sekvensering, validering av varianter i et genomisk intervall og utarbeidelse av visuals for rapporter eller publikasjoner. Verktøyet er tiltenkt forskere, klinikere og dataansvarlige som trenger rask visualisering uten installasjon og personvern i nettleseren. Ytelsen er optimalisert for moderate datamengder og streaming fra eksterne servere der det støttes.