IGV Web Tool

IGV Web Tool gengiver afstemte reads, varianter og annoteringsspor direkte i browseren. Brugerne indlæser BAM/CRAM, VCF, BED/BigWig‑data til en valgt genomisk build og region. Den understøtter multi‑track visning, koordinatbaserede forespørgsler og klientside caching til glidende udforskning. Konceptuelt strømmer data eller åbner dem fra lokale filer, afkodes og visualiseres som dækningsstænger, læseopstillinger og varianthåndmærker. Værktøjet fokuserer på hurtig inspektion, reproducerbarhed og nem deling af visninger mellem forskere. Værdien ligger i browserens indbyggede drift, understøttelse af eksterne datakilder og lette eksportmuligheder for figurer eller konfigurationer. Kernfunktioner: (1) koordinatnavigering, (2) multi‑track rendering, (3) grundlæggende filtrering efter kvalitet eller allel, (4) lokal og fjern dataadgang, (5) per‑track konfiguration og farvekodning, (6) eksport af aktuelle visning til JSON eller billede, (7) regionbaserede forespørgsler for hurtige tjek på tværs af prøver. Anvendelsesområder: QC‑kontroller af sekventering, validering af varianter i et genomisk interval og udarbejdelse af visuals til rapporter eller publikationer. Værktøjet henvender sig til forskere, klinikere og dataansvarlige, der har brug for en hurtig, installationsfri visualisering og privatliv i browseren. Ydelsen er optimeret til moderate datamængder og streaming fra eksterne servere, hvor det understøttes.