IGV Web Tool

O IGV Web Tool renderiza leituras alinhadas, variantes e faixas de anotação diretamente no navegador. Os usuários carregam dados BAM/CRAM, VCF, BED/BigWig para uma construção genômica e região escolhidas. Suporta visualizações multi-faixa, consultas baseadas em coordenadas e cache do lado do cliente para exploração suave. Conceitualmente, os dados são transmitidos ou abertos a partir de arquivos locais, decodificados e visualizados como barras de cobertura, layouts de leitura e marcadores de variantes. A ferramenta enfatiza inspeção rápida, reprodutibilidade e compartilhamento fácil de visualizações entre pesquisadores. O valor único vem do funcionamento nativo do navegador, suporte a fontes de dados remotas e opções leves de exportação para figuras ou configurações. Principais recursos: (1) navegação por coordenadas, (2) renderização multi-faixa, (3) filtragem básica por qualidade ou alelo, (4) acesso a dados locais e remotos, (5) configuração por faixa e codificação por cores, (6) exportação da vista atual para JSON ou imagem, (7) consultas por região para verificações rápidas entre amostras. Casos de uso: checagens de QC em rodadas de sequenciamento, validação de variantes em um intervalo genômico e preparação de visuais para relatórios ou publicações. A ferramenta é destinada a pesquisadores, clínicos e gerentes de dados que precisam de visualização rápida sem instalação e com privacidade dos dados no navegador. O desempenho é otimizado para tamanhos de dados moderados e streaming de segmentos de servidores remotos quando suportado.