VEP Web Tool

כלי אינטרנטי לחוקרים ולקלינאים לחזות ולהannotate השלכות וריאנטים גנומיים מ-VCF או מרשימת וריאנטים.

Tool coming soon!

We're working hard to get this tool ready for you.

Request Feature / Support

1,516+

Total Calculations Run

< 15ms

Browser Execution Speed

100%

Client-Side Privacy

4.9 / 5.0

User Satisfaction

AI Web Tool Generator

Build Your Own Custom Web Calculator in Seconds

Type what tool or calculator you need below. Our AI will build it instantly for your site.

אודות כלי זה

VEP Web Tool מספק ייעוד אוטומטי והשלכות צפויות לווריאנטים גנומיים המתוארים ב-VCF או ברשימת וריאנטים. הכלי תומך בניתוח בהמונים וחוזר עבור כל וריאנט נתונים כמו גן, טרנסקריפט, השלכה צפויה, HGVS, שינויים בח amino acids וה HGVS. הכלי מיועד לחוקרים, קלינאים וביואינפורמטיקאים שזקוקים לANNOTATION מהיר ללא התקנת תוכנה בסביבת עבודה מקומית.

הגדרה ת conceptual שתואר באמצעות טרנסקריפטים ייעודיים של אורגניזם והרכבה. הכלי מחשב השלכות לכל טרנסקריפט באמצעות דירוג תקני (גבוה/מתון/נמוך/ Modifier) ויכול לדווח את כל הטרנסקריפים או טרנסקריפט ראשי שנבחר על ידי המשתמש. הפלטים בנויים לפריטציה תכנותית וצינורות בעבודה.

הערך הייחודי lies בקליטת זמן-אמת בסביבה אינטרנטית, יכולת התמודדות עם מערכי וריאנטים גדולים ואפשרות אינטגרציה עם מקורות Annotציה נוספים. הוא מצמצם זמן עריכה ידני, תומך בנתונים מאורגנים לחיקור ול- QC קליני. תכונות עיקריות כוללות: קלט ב-VCF או בפורמט tab-delimited; ציון אורגניזם והרכבה; העדפה לטרנסקריפט; Annotaciones עבור וריאנט עם גן, טרנסקריפט, השלכה, שינוי חומצות אמינו HGVS; אפשרויות ייצוא TSV או JSON; ותמיכה בעבודה אוטומטית. מקרי שימוש כוללים גילוי וריאנטים, Pipelines ל annotation ומחקר דיאגנוסטי.

Save your calculation history with a free account

איך להשתמש

העלה קובץ VCF או הדבק רשימת וריאנטים טאב-מופרדים; בחר אורגניזם והרכבה.
הגדר אפשרויות כמו העדפת טרנסקריפט (קאנוני vs כולם) או מסננים/מקורות Annotציה נוספים.
הרץ את האנליזה כדי ליצור Annotציות לכל וריאנט.
הצג פלטים בחלונית התוצאות והפעל מסננים לפי השפעה, גן או טרנסקריפט.
ייצא את התוצאות כ- TSV או JSON לתהליכים בהמשך.

Frequently Asked Questions

מצא תשובות מהירות

אילו פורמטים של קלט נתמכים?

הכלי מקבל קובצי VCF או רשימת וריאנטים מופרדי טאב. וריאנטים חייבים להתייחס להרכבה שנבחרה. קלטים גדולים עוברים לעיבוד בחלקים כדי לשמור על ביצועים, ותמיכה בכותרת פשוטה לייבוא tabulated.

אילו בניות של הגנום נתמכות?

בניית נתמכות כוללות GRCh37 ו-GRCh38. אם נתוניכם משתמשים בבנייה אחרת, בצעו טרנסליפטרו מראש או בחרו את ההרכבה הקרובה הנתמכת ביותר; Annotation מבוססת על התייחסות לקאנוני.

איך נבחרים טרנסקריפטים?

ניתן לבצע Annotaciones עם טרנסקריפט קאנוני לכל גן או לבקש Annotazioni לכל הטרנסקריפטים. כאשר קיימים מספר טרנסקריפטים, הכלי יכול לדווח את כולם או את הטרנסקריפט הראשי שנבחר על ידי המשתמש.

איזה פלט מוצג?

לכל וריאנט תקבלו גן, טרנסקריפט, השלכה צפויה, HGVS, שינויים בחומצות אמינו והשפעה מודפעת. הפלטים ניתנים לייצוא כ- TSV או JSON כך שניתן לשלבם בתהליכים אוטומטיים.

Need to run multiple calculations?

Create a free account today to unlock unlimited daily runs, access advanced parameters, save your history, and request custom features.

Related Tools

Other useful calculators and utilities you might like

ממיר Spotify ל-MP3

ממיר קבצי שמע מסופקים מקומית ל-MP3, מאפשר האזנה offline ותאימות בין מכשירים למוזיקה בבעלות חוקית ואח...

מחשב מרחק דרך

מחשב מרחק דרך למטיילים, מתכנני לוגיסטיקה ונהגים כדי להעריך במהירות מרחקים וזמן בין מקומות.

מחשבון גיל

קבע במהירות את גיל האדם מבוסס על תאריך הלידה שלו עם המחשבון החינמי שלנו באינטרנט, מתאים לשימוש אישי...

הממיר מטבעות

המיר במהירות סכומים בין מטבעות שונים עם הממיר חינם שלנו, מתאים לנסיעות, עסקים וקונים בינלאומיים.

המשוב שלך חשוב

עזור לנו לשפר