MzIdentML Converter

About This Tool

mzIdentML Converter läser mzIdentML-filer och producerar analysklara tabeller. Den standardiserar fältnamn för identifikationer, inklusive peptidsekvenser, proteinreferenser, poäng och modifieringar, så att resultaten kan användas i efterföljande analyser och datalager. Konceptuellt analyserar verktyget mzIdentML-strukturen, extraherar PSM:er och proteinmappningar och exporterar dem till platta format som är lätta att sammanfoga med andra datakällor. Det stödjer både enkla och batcharbetsflöden och bevarar provenance metadata såsom sökmotor och filtreringskriterier. Användare drar nytta av en konsekvent exportväg som minskar manuell omstrukturering och förbättrar reproducerbarheten i projekt. Kärnfunktioner inkluderar schemasvalidering, fältmappning, decoy-hantering och alternativ korsreferens till proteindatabaser. Konverteraren är utformad för reproducerbara pipelines och erbjuder alternativ för att anpassa synliga kolumner, inkludera detaljerad modifieringsinformation och exportera i flera format för olika analyssteg. Typiska användningsfall inkluderar datapreparation för statistiska analyser, inlämning av identifieringar till offentliga repositories eller driva dashboards med uppdaterade resultat. Verktyget fokuserar på robust felrapportering, revisionstrails och kompatibilitet med mzIdentML-versioner 1.2 och 1.4, vilket möjliggör datautbyte utan att metadata och poänginformation går förlorad.

Sign in to see all your usage