MzIdentML Converter

About This Tool

De mzIdentML Converter leest mzIdentML-bestanden en produceert analyseklare tabellen. Het standaardiseert veldnamen voor identifications, inclusief peptidenreeksen, eiwitreferenties, scores en modificaties, zodat resultaten kunnen worden geïntegreerd in downstream analyses en repositories. Conceptueel analyseert de tool de mzIdentML-structuur, extraheert PSM’s en eiwittoewijzingen, en exporteert ze naar platte formaten die gemakkelijk kunnen worden gekoppeld aan andere databronnen. Het ondersteunt enkelvoudige en batch-workflows en bewaart herkomstmetadata zoals zoekmachine en filtratiecriteria. Gebruikers profiteren van een consistente exportroute die handmatig herformatteren vermindert en de reproduceerbaarheid verhoogt in projecten. Kernfuncties omvatten schema-validatie, veldkoppeling, decoy-handling en optionele eiwitdatabank-koppeling. De converter is ontworpen voor reproduceerbare pipelines en biedt opties om zichtbare kolommen aan te passen, gedetailleerde modifatie-informatie op te nemen en exporteren in meerdere formaten voor verschillende analyses. Typische use-cases omvatten data-preparatie voor statistische analyses, het indienen van identificaties bij openbare repositories of het aandrijven van dashboards met actuele resultaten. De tool legt de nadruk op robuuste foutmelding, audit-trails en compatibiliteit met mzIdentML-versies 1.2 en 1.4, waardoor onderzoekers data kunnen uitwisselen terwijl belangrijke metadata en scoringsinformatie behouden blijft.

Sign in to see all your usage