MzIdentML Converter

Convierte identificaciones mzIdentML a CSV, TSV o JSON para análisis y reportes posteriores.

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Sobre esta herramienta

El mzIdentML Converter lee archivos mzIdentML y genera tablas listas para el análisis. Estandariza nombres de campos para identificaciones, incluidas secuencias de péptidos, referencias proteicas, puntuaciones y modificaciones, para que los resultados puedan integrarse en análisis y repositorios posteriores. Conceptualmente, la herramienta analiza la estructura mzIdentML, extrae PSM y mapeos de proteínas, y los reexporta en formatos planos fáciles de unir con otras fuentes de datos. Soporta flujos de trabajo simples y por lotes y conserva metadatos de procedencia como motor de búsqueda y criterios de filtrado. Los usuarios se benefician de una ruta de exportación coherente que reduce la reformatación manual y mejora la reproducibilidad en proyectos. Funciones clave: validación de esquema, mapeo de campos, manejo de decoys y referencia opcional a bases de datos proteicas. El convertidor está diseñado para pipelines reproducibles y ofrece opciones para personalizar columnas visibles, incluir información detallada sobre modificaciones y exportar en múltiples formatos para diferentes fases analíticas. Casos de uso típicos incluyen preparación de datos para análisis estadísticos, envío de identificaciones a repositorios públicos o alimentar dashboards con resultados actualizados. La herramienta enfatiza informes de errores robustos, trazabilidad y compatibilidad con versiones mzIdentML 1.2 y 1.4, lo que permite a investigadores intercambiar datos preservando metadatos e puntuaciones críticas.

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Cómo usar

1. Cargue su archivo mzIdentML y elija el formato de salida deseado (CSV, TSV o JSON)
2. Establezca controles opcionales: include_decoys, max_records y una ruta opcional para proteindb para mapeo de referencia
3. Ejecute la conversión para generar el archivo de salida y un resumen
4. Descargue el archivo convertido y revise el informe resumen para comprobar la integridad
5. Integre los outputs en análisis posteriores o repositorios de datos

Preguntas frecuentes / Recursos adicionales

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Qué formatos de salida son compatibles?

¿Valida mzIdentML frente al esquema?

¿Puedo procesar varios archivos en lote?

¿Se conservan datos de decoy y de modificaciones?

Opiniones de los usuarios

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