MzIdentML Converter

Om dette verktøyet

mzIdentML Converter leser mzIdentML-filer og produserer analyseklare tabeller. Den standardiserer feltnavn for identifikasjoner, inkludert peptidsekvenser, proteinreferanser, poeng og modifikasjoner, slik at resultatene kan brukes i påfølgende analyser og databaser. Konseptuelt analyserer verktøyet mzIdentML-strukturen, trekker ut PSM-er og protein-tilordninger og eksporterer dem til flate formater som enkelt kan kobles til andre datakilder. Den støtter både enkeltfil og batch-workflows og bevarer provenance metadata som søkeverktøy og filtreringskriterier. Brukere drar nytte av en konsekvent eksportsti som reduserer manuell omstrukturering og forbedrer reproduksjonsevnen i prosjekter. Nøkkelfunksjoner inkluderer skjemavalidering, felttildeling, decoy-håndtering og valgfri kobling til proteindatabaser. Converteren er utviklet for reproduksjonbare pipelines og tilbyr alternativer for å tilpasse synlige kolonner, inkludere detaljert modifikasjonsinformasjon og eksportere i flere formater for ulike analysefaser. Typiske bruksområder inkluderer forberedelse av data til statistiske analyser, innlevering av identifikasjoner til offentlige repositories eller drift av dashbord med oppdaterte resultater. Verktøyet legger vekt på robust feilrapportering, revisjonstrails og kompatibilitet med mzIdentML-versjonene 1.2 og 1.4, slik at forskere kan utveksle data uten å miste metadata og scoringsinformasjon.

Logg inn for å se all din bruk