MzIdentML Converter

המר זיהויי mzIdentML ל-CSV, TSV או JSON לניתוחים ודיווחים מאוחרים.

בדוק את זה בעצמך

קרא לכלי באמצעות API הטמע באתר שלך פרסם כאן

אודות כלי זה

MzIdentML Converter קורא לקבצי mzIdentML ומייצר טבלאות מוכנות לניתוח. הוא מאחזר שמות שדות מאורגנים לזיהויים, כולל רצף פּפטידים, התייחסויות לחלבונים, ניקוד/modifications. התוצאות יכולות להשתלב בניתוחים ואחסונות מאוחרים. מבחינה מושגית, הכלי מנתח את מבנה mzIdentML, מייצא PSM ומיפויי חלבונים ומציג אותם בפורמטים שטוחים שקל להצמדם למקורות נתונים אחרים. הוא תומך בזרימות עבודה יחידות וב-batch ושומר נתוני מוצא כמו מנוע חיפוש וקריטריוני סינון. המשתמשים נהנים מנתיב ייצוא עקבי שמפחית המרת תצורה ידנית ומשפר את החזריות בפרויקטים. תכונות clés כוללות אימות סכמות, מיפוי שדות, טיפול בעמדות decoy ואפשרות התייחסות למסדי נתונים proteics. הממיר תוכנן עבור צינורות שיחשפו מחדש, ומציע אפשרויות לכוונן עמודות נראות, לכלול מידע מפורט על Modifications ולייצא במגוון פורמטים לשלבי ניתוח שונים. דוגמאות שימוש נפוצות כוללות הכנת נתונים לניתוחים סטטיסטיים, הגשת זיהויים למאגרים ציבוריים או הפעלת לוחות בקרה עם תוצאות עדכניות. הכלי מדגיש דיווחי שגיאות חזקים, מסלולי ביקורת ותאימות לגרסאות mzIdentML 1.2 ו-1.4, שמאפשרים לחוקרים להחליף נתונים תוך שמירה על המטא-נתונים והציונים הקריטיים.

היכנס כדי לראות את כל השימוש שלך

איך להשתמש

1. טען את הקובץ mzIdentML ובחר את פורמט הפלט הרצוי (CSV, TSV או JSON)
2. הגדר בקרה אופציונלית: include_decoys, max_records ונתיב optional ל-protein_db למיפוי התייחסות
3. הרץ את ההמרה כדי ליצור את קובץ הפלט והסיכום
4. הורד את הקובץ שהומר ובחן את הדוח לסיפוק השלמות
5. שלב את התוצאות בניתוחים בהמשך או במחסני נתונים

שאלות נפוצות / משאבים נוספים

מצא תשובות מהירות

אילו פורמטים של פלט נתמכים?

האם הוא מאמת mzIdentML מול הסכימה?

האם אפשר לעבד מספר קבצים בטאץ’?

האם decoy ומידע modificator נשמרים?

ביקורות משתמשים

ראה מה אחרים אומרים