MzIdentML Converter
Converte identificações mzIdentML para CSV, TSV ou JSON para análises e relatórios subsequentes.

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About This Tool
O mzIdentML Converter lê arquivos mzIdentML e produz tabelas prontas para análise. Ele padroniza nomes de campos para identificações, incluindo sequências de peptídeos, referências proteicas, escores e modificações, para que os resultados possam ser integrados em análises e repositórios subsequentes. Conceitualmente, a ferramenta analisa a estrutura mzIdentML, extrai PSMs e mapeamentos de proteínas e os reexporta em formatos planos fáceis de combinar com outras fontes de dados. Suporta fluxos de trabalho simples e em lote e preserva metadados de proveniência, como motor de busca e critérios de filtragem. Os usuários se beneficiam de um caminho de exportação consistente que reduz a re-formatação manual e amplia a reprodutibilidade em projetos. Funcionalidades-chave incluem validação de esquema, mapeamento de campos, tratamento de decoys e referência opcional a bancos de proteínas. O conversor foi projetado para pipelines reprodutíveis e oferece opções para personalizar colunas visíveis, incluir informações detalhadas sobre modificações e exportar em múltiplos formatos para diferentes fases analíticas. Casos de uso típicos incluem preparação de dados para análises estatísticas, envio de identificações para repositórios públicos ou alimentar dashboards com resultados atualizados. A ferramenta enfatiza relatórios de erro robustos, trilhas de auditoria e compatibilidade com as versões mzIdentML 1.2 e 1.4, permitindo que pesquisadores troquem dados preservando metadados e pontuações críticas.
How to Use
1. Carregue o arquivo mzIdentML e escolha o formato de saída desejado (CSV, TSV ou JSON)
2. Defina controles opcionais: include_decoys, max_records e um caminho opcional para proteindb para mapeamento de referência
3. Execute a conversão para gerar o arquivo de saída e o resumo
4. Faça o download do arquivo convertido e revise o relatório-resumo para integridade
5. Integre as saídas em análises subsequentes ou repositórios de dados

FAQs/Additional Resources
Find Quick Answers
Quais formatos de saída são suportados?
Valida mzIdentML contra o esquema?
Posso processar vários arquivos em batch?
Dados decoy e modificações são preservados?
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