Video In Vivo Toolbox

Verktyget tar in en video från användardatat och analyserar en definierad tidsvindu för att beräkna kärnbildningsmått. Det stödjer valfria ROI-definitioner och flera analyslägen, inklusive ljusstyrka, rörelse och ROI-baserade intensiteter. Utdata inkluderar varaktighet, bildfrekvens och ROI-statistik, vilket möjliggör konsekvent rapportering över experiment. Det är avsett för in vivo-forskning där tid och intresseområde måste mätas för jämförelser eller QA. Bakom kulisserna läser verktyget ramar, konverterar dem till ett konsekvent färgrum och beräknar luminansbaserade mått. Rörelsen kvantifieras via frame-to-frame-differenser, normaliserade till antalet frames. Om fluorescenskanaler finns beräknas kanal-spezifika intensiteter inom varje ROI. Valideringar säkerställer att start_time och end_time definierar ett giltigt fönster och ROI-koordinater ligger inom bildens gränser. Saknade data eller icke-stödna codecs ger strukturerade felmeddelanden snarare än UI-meddelanden. Mottagare inkluderar imaging-core-faciliteter, bioingenjörslabb och forskare som gör longitudinella in vivo-studier. Verktyget ger reproducerbara mätningar, revisionsspår och enkla exportalternativ, vilket minskar manuell beräkning och möjliggör jämförelser mellan studier. Unik styrka ligger i in vivo-inriktat ROI-stöd, robust hantering av vanliga biomedicinska videofomater och en kompakt JSON-rapport som passar automatiserade pipeline.