Video In Vivo Toolbox

Lo strumento importa un video dal set di dati dell’utente e analizza una finestra temporale definita per calcolare metriche chiave dell’imaging. Supporta definizioni ROI opzionali e molteplici modalità di analisi, tra cui luminosità, movimento e intensità basate sul ROI. Le uscite includono durata, frame rate e statistiche ROI, favorendo una reportistica coerente tra esperimenti. È progettato per flussi di lavoro di ricerca in vivo in cui è necessario misurare tempi e regioni di interesse per confronti o QA. In background lo strumento legge i frame, li converte in uno spazio colore coerente e calcola metriche basate sulla luminanza. Il movimento è quantificato tramite differenze frame-to-frame normalizzate al numero di frame. Se presenti, canali di fluorescenza producono statistiche specifiche per canale all’interno di ciascun ROI. Verifiche garantiscono che start_time e end_time definiscano una finestra valida e che le coordinate ROI siano entro i confini del frame. Dati mancanti o codec non supportati producono segnali di errore strutturati. Destinatari includono centri di imaging, laboratori di bioingegneria e ricercatori che conducono studi in vivo longitudinali. Lo strumento offre metriche riproducibili, audit trail e esportazioni semplici, riducendo calcoli manuali e facilitando confronti tra studi. Il valore unico risiede nel supporto ROI orientato in vivo, gestione robusta dei formati video biomedici comuni e un report JSON compatto adatto a pipeline automatizzate.