Video In Vivo Toolbox

La herramienta toma un video del conjunto de datos del usuario y analiza una ventana temporal definida para calcular métricas centrales de imágenes. Admite definiciones de ROI opcionales y múltiples modos de análisis, incluyendo brillo, movimiento e intensidades basadas en ROI. Las salidas incluyen duración, velocidad de fotogramas y estadísticas por ROI, permitiendo informes consistentes entre experimentos. Está diseñada para flujos de trabajo de investigación in vivo donde el control de temporización y la región de interés deben medirse para comparaciones o QA. Detrás de escena, la herramienta lee cuadros, los convierte a un espacio de color coherente y calcula métricas basadas en la luminancia. El movimiento se cuantifica mediante diferencias frame-to-frame, normalizadas por el número de fotogramas. Si existen canales de fluorescencia, se calculan intensidades específicas por canal dentro de cada ROI. Las validaciones aseguran que start_time y end_time definan una ventana válida y que las coordenadas ROI estén dentro de los límites del cuadro. Datos ausentes o códecs no soportados generan señales de error estructuradas en lugar de mensajes de interfaz. Los beneficiarios incluyen instalaciones de imagen, laboratorios de bioingeniería e investigadores que realizan estudios longitudinales in vivo. La herramienta ofrece métricas reproducibles, rutas de auditoría y opciones de exportación simples, reduciendo cálculos manuales y facilitando comparaciones entre estudios. Su valor único deriva del soporte ROI orientado in vivo, manejo robusto de formatos de video biomédicos comunes y un informe JSON compacto apto para pipelines automatizados.