Video In Vivo Toolbox

Verktøyet leser inn en video fra brukerens datasett og analyserer et definert tidsvindu for å beregne kjernebildemålinger. Det støtter valgfrie ROI-definisjoner og flere analysemoduser, inkludert lysstyrke, bevegelse og ROI-baserte intensiteter. Utdata inkluderer varighet, bildefrekvens og ROI-statistikker, noe som muliggjør konsekvent rapportering på tvers av eksperimenter. Det er laget for in vivo-forskningsarbeidsflyter der timingstyring og interesseområder må måles for sammenligninger eller QA. Bak kulissene leser verktøyet rammer, konverterer dem til et konsistent farverom og beregner luminans-baserte metrikk. Bevegelse kvantifiseres via frame-to-frame differanser, normalisert til antall rammer. Hvis fluorescenskanaler finnes, beregnes kanal-spesifikke intensiteter innen hver ROI. Valideringer sikrer at start_time og end_time definerer et gyldig vindu og ROI-koordinater ligger innenfor rammene. Manglende data eller ikke-støttede codecs gir strukturerte feilmeldinger i stedet for UI-meldinger. Mottakere inkluderer imaging-corefasiliteter, bioingeniør-laboratorier og forskere som gjennomfører longitudinelle in vivo-studier. Verktøyet gir reproducerbare målinger, revisjonsspor og enkle eksportalternativer, noe som reduserer manuelt arbeid og muliggjør sammenligning mellom studier. Unik verdi ligger i in vivo-ROI-støtte, robust håndtering av vanlige biomedisinske videofilformater og en kompakt JSON-rapport som passer til automatiserte pipelines.