Video In Vivo Toolbox

A ferramenta lê um vídeo do conjunto de dados do usuário e analisa uma janela temporal definida para calcular métricas centrais de imageamento. Suporta definições opcional de ROI e vários modos de análise, incluindo brilho, movimento e intensidades baseadas em ROI. As saídas incluem duração, taxa de quadros e estatísticas por ROI, permitindo relatórios consistentes entre experimentos. É projetada para fluxos de trabalho de pesquisa in vivo onde o controle de tempo e regiões de interesse devem ser mensurados para comparação ou QA. Por trás, a ferramenta lê quadros, os converte para um espaço de cor consistente e calcula métricas baseadas em luminância. O movimento é quantificado via diferenças frame-to-frame normalizadas pelo número de quadros. Se canais de fluorescência existirem, são calculadas intensidades por canal dentro de cada ROI. Validações asseguram que start_time e end_time definam uma janela válida e que as coordenadas ROI estejam dentro dos limites do quadro. Dados ausentes ou codecs não suportados geram sinais de erro estruturados em vez de mensagens de UI. Destinatários incluem instalações de imageamento, laboratórios de bioengenharia e pesquisadores que realizam estudos in vivo longitudinais. A ferramenta oferece métricas reprodutíveis, trilhas de auditoria e opções de exportação simples, reduzindo cálculos manuais e permitindo comparações entre estudos. Valor único reside no suporte ROI in vivo, manejo robusto de formatos de vídeo biomédicos comuns e um relatório JSON compacto para pipelines automatizados.