Taxa Converter

About This Tool

Taxa Converter ger tvärdatabas-mappning av taxonomiska identiteter, namn och rangordningar över större databaser. Indata accepteras som IDs eller kanoniska namn och ger standardiserade utdata med tillförlitlighetsvärden för att styra efterföljande analyser. Systemet bygger konceptuellt på korsreferenstabeller, synonymlösningsregler och rangnormalisering för att producera konsekventa taxonreferenser. Det stödjer både enstaka sökningar och batch-behandling, vilket gör det möjligt för forskare att integrera taxonomiska data i pipelines med minimal manuell curering. Användare drar nytta av mindre manuell korsreferens, förbättrad datakvalitet och snabbare publiceringsberedskap. Det unika värdet ligger i kombinationen av bidirektionell kartläggning, tydlig tillförlitlighetsbedömning och utbyggbar databassupport, vilket möjliggör robust taxonreconciliation över källor. Huvudfunktioner: (1) källa- till mål-mappning mellan NCBI Taxonomy, ITIS, GBIF, Catalogue of Life och WoRMS; (2) namn- till-ID och ID- till-namn uppslag med rangjustering; (3) valfri fuzzy-matchning med tillförlitlighetsmått; (4) batch-behandling via API eller filuppladdningar; (5) exportklara utdata i JSON, CSV eller TSV. Användningsfall omfattar dataintegration för publicering, metadata-kuration och utbildningsdataset där taxonomisk konsekvens är viktig. Detta verktyg är avsett för bioinformatiker, kuratorer och forskare som kräver pålitliga cross-database korsningar och granskningsvänliga utdata för reproducerbar vetenskap.

Sign in to see all your usage