Taxa Converter

Taxa Converter ofrece conversión rápida basada en reglas de identificadores taxonómicos para investigadores, docentes y biocuradores que requieren compatibilidad entre bases de datos biológicas.

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Sobre esta herramienta

Taxa Converter ofrece mapeo entre bases de datos de identificadores, nombres y rangos taxonómicos en bases de datos principales. Acepta entradas como IDs o nombres canónicos y devuelve salidas estandarizadas con puntuaciones de confianza para guiar análisis posteriores. El sistema se apoya conceptualmente en tablas de cruce, reglas de resolución de sinónimos y normalización de rangos para producir referencias taxonómicas consistentes. Soporta consultas individuales y procesamiento por lotes, permitiendo que los investigadores integren datos taxonómicos en pipelines con mínima curación manual. Los usuarios se benefician de menos referencias cruzadas manuales, mejor calidad de datos y una mayor preparación para la publicación. El valor único reside en la combinación de mapeo bidireccional, puntuación de confianza explícita y soporte ampliable de bases de datos, que permiten una reconciliación taxonómica robusta entre fuentes. Funciones clave: (1) mapeo fuente-a-meta entre NCBI Taxonomy, ITIS, GBIF, Catalogue of Life y WoRMS; (2) búsquedas nombre-a-ID e ID-a-nombre con alineación de rango; (3) coincidencia difusa opcional con métricas de confianza; (4) procesamiento por lotes vía API o cargas de archivos; (5) salidas listas para exportar en JSON, CSV o TSV. Casos de uso: integración de datos para publicación, curación de metadatos y conjuntos educativos donde la consistencia taxonómica es esencial. Esta herramienta está diseñada para bioinformáticos, curadores e investigadores que requieren cruces entre bases de datos fiables y salidas auditables para una ciencia reproducible.

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Cómo usar

Proporcionar entradas: suministre source_taxon o source_id y seleccione la base de datos fuente.
Elegir base de datos objetivo o dirección de mapeo.
Ejecutar la conversión: búsqueda única o procesamiento por lotes.
Revisar salidas: ver target_id, target_name, target_rank y confianza.
Exportar resultados: guardar como CSV o JSON para pipelines.

Preguntas frecuentes / Recursos adicionales

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Qué entradas se aceptan?

Qué bases de datos son compatibles?

Cómo se mide la precisión?

¿Hay procesamiento por lotes?

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