Taxa Converter

Taxa Converter tilbyder hurtig, regelbaseret konvertering af taxonomiske identifikatorer for forskere, undervisere og biokuratorer, der har brug for tværsat databaser kompatibilitet.

Tjek det selv

Kald værktøj via API Indlejr på din side Annoncér her

Om dette værktøj

Taxa Converter giver kryds-database kortlægning af taxonomiske identifikatorer, navne og rangordner på tværs af større databaser. Inddata kan indtastes som IDs eller kanoniske navne og giver standardiserede outputs med tillidsmålinger til at guide efterfølgende analyser. Systemet hviler principielt på crosswalk-tabeller, regler for synonymløsning og rangnormalisering for at producere konsistente taxonreferencer. Det understøtter både enkeltopslag og batch-behandling, så forskere kan integrere taxonomiske data i pipelines med minimal manuel kuratering. Brugere drager fordel af mindre manuel krydsreferencing, forbedret datakvalitet og hurtigere publiceringsklarhed. Den unikke værdi ligger i kombinationen af bivector mapping, eksplicit tillidsmåling og udvideligdatabaser support, som tilsammen muliggør robust taxaafstemning på tværs af kilder. Kernefunktioner: (1) kilde-til-mål mapping mellem NCBI Taxonomy, ITIS, GBIF, Catalogue of Life og WoRMS; (2) navn-til-ID og ID-til-navn opslag med rangjustering; (3) valgfri fuzzy-matchning med tillidsmetrikker; (4) batch-behandling via API eller filupload; (5) eksportklare outputs i JSON, CSV eller TSV. Anvendelsestilfælde spænder fra dataintegration til publikation, metadata-kuration og undervisningsdatasæt, hvor taxonomisk konsistens er essentiel. Dette værktøj henvender sig til bioinformatikere, curators og forskere, der kræver pålidelige cross-database korsninger og revisionsvenlige uddata til reproducerbar videnskab.

Log ind for at se al din brug

Sådan bruges

Angiv inputs: angiv source_taxon eller source_id og vælg kilde-databasen.
Vælg mål-databasen eller kortlægningsretning.
Kør konvertering: enkelt opslag eller batch-behandling.
Gennemgå outputs: kontroller target_id, target_name, target_rank og tillid.
Eksporter resultater: gem som CSV eller JSON til pipelines.

Ofte stillede spørgsmål / yderligere ressourcer

Find hurtige svar

Hvilke inputs accepteres?

Hvilke databaser understøttes?

Hvordan måles nøjagtighed?

Er batch-behandling tilgængelig?

I hvilke formater kan outputs eksporteres?

Brugeranmeldelser

Se hvad andre siger