Oligo Analyzer 3.1

Dette værktøj analyserer oligonukleotider, der bruges i primers, probes, adapters og sequencing-biblioteker. Det giver vigtige egenskaber som smeltet temperatur, GC-indhold, molekylvægt og extinction-koefficient til støtte for designbeslutninger og QC. Arbejdsflows accepterer canoniske DNA- eller RNA-sekvenser og valgfri buffersparametre for at tilpasse beregninger til virkelige forhold.
Konceptrigtigt indtaster brugeren sekvensen og angiver oligo-typen; motoren anvender en nær-thermodynamisk model med saltkorrektioner til at estimere Tm, beregner GC-procenten, udleder molekylvægten ud fra nukleotidvægte og estimerer extinction-koefficienten ud fra base-sammensætningen. En simpel sekundærstrukturrisikovurdering markerer potentielle hairpins eller repeterende motiver, der kan påvirke ydeevnen. Resultaterne vises som numeriske værdier og en kort risikovurdering for at lede udvælgelse og syntesebeslutninger.
Værdien af værktøjet ligger i konsoliderede, reproducerbare målinger: en enkelt kilde til Tm, GC-indhold, MW og mærkingsmétrikker for DNA- og RNA-oligos. Anvendelser inkluderer primer-/probe-design, kloningsworkflows, qPCR-opsætning og bibliotekforberedelse, hvor hurtig screening og standardiseret rapportering fremskynder udvikling og reducerer bestillingsfejl. Avancerede brugere kan eksportere CSV/JSON-rapporter til integration med design-notatbøger og LIMS-pipelines.