15N-spårningsanalysator

Detta verktyg analyserar isotopiska tracer-data från 15N-experiment och ger korrigerade berikningsmått samt, vid behov, enkla flux-estimeringar. Det riktar sig till forskare inom metabolomics, biokemi och systembiologi som behöver en transparent, reproducerbar analys av isotopetikering när de designar eller tolkar tracer-experiment.
Konceptuellt läser det in en tabellbaserad dataset, tillämpar korrigering för naturlig förekomst på 15N-signaler, omvandlar dem till fraktionell berikning och grupperar resultaten per metabolit och tidpunkt. Om ett nätverk av metaboliter tillhandahålls eller antas, uppskattar det fluxer med en enkel massbalansmodell och minsta kvadrater-minimering; osäkerhet kan Approx via bootstrap.
Kärnfunktioner inkluderar dataintag; 15N-korrigering; beräkning av fraktionell berikning; alternativ fluxestimering; exportbara resultat; och stöd för flera tidssteg. Verktyget följer standardisera isotop-definitioner och SI-enheter, vilket möjliggör labövergripande användning och reproducerbar dokumentation.
Användningsfall inkluderar att följa märkning över tid, jämföra betingelser och validera vägaktiviteter. Det särskiljer sig genom en integrerad korrigering- och minimalmodellering-pipeline som är lämplig för publikation-klara figurer och reproducerbara analyser.