15N-sporingsanalyseverktøy

Dette verktøyet analyserer isotopiske tracerdata fra 15N-eksperimenter og gir korrigerte berikelsesmål og, om ønskelig, enkle fluxestimeringer. Det henvender seg til forskere innen metabolomics, biokjemi og systembiologi som trenger en transparent, reproducerbar analyse av isotopmerking ved utforming eller tolkning av tracer-eksperimenter.
Konseptuelt leser det inn et tabellbasert datasett, anvender korrigering for naturlig forekomst på 15N-signaler, omformer dem til fraksjonell berigelse og grupperer resultatene etter metabolitt og tid. Når det foreligger et nettverk av metabolitter via input eller antagelser, estimerer det fluxer ved hjelp av en enkel massesbalansemodell og minste-kvadrater-minimering; usikkerhet kan tilnærmes via bootstrap.
Kjernfunksjoner inkluderer dataimport; 15N-korreksjon; beregning av fraksjonell berigelse; valgfri fluxestimering; eksportbare resultater; og støtte for flere tidspunkter. Verktøyet bruker standard isotop-definisjoner og SI-enheter, som muliggjør tverrlab-bruk og reproducerbar dokumentasjon.
Bruksområder inkluderer å følge merking over tid, sammenligne forhold og validere pathway-aktiviteter. Det skiller seg ut ved å tilby en integrert korrigering og minimal modellering-pipeline som passer for publikasjonsklare figurer og reproducerbare analyser.