Analyseur de traçage 15N

Cet outil analyse les données de traceur isotopique provenant d’expériences 15N pour fournir des mesures d’enrichissement corrigées et, éventuellement, des estimations simples de flux. Il cible les chercheurs en métabolomique, biologie biologique et biologie des systèmes qui ont besoin d’une analyse transparente et reproductible des données d’étiquetage isotopique lors de la conception ou l’interprétation d’expériences de traçage.
Conceptuellement, il lit un jeu de données tabulaire, applique une correction de l’abondance naturelle sur les signaux 15N, les transforme en enrichissement fractionnel, et agrège les résultats par métabolite et par point temporel. Lorsque un réseau de métabolites est fourni via les entrées ou supposé, il estime les flux à l’aide d’un modèle simple de bilan de masse et d’une minimisation par moindres carrés; l’incertitude peut être approchée via le bootstrap.
Les fonctionnalités clés incluent l’ingestion de données; correction 15N; calcul d’enrichissement fractionnel; estimation de flux optionnelle; résultats exportables; et prise en charge de multiples points dans le temps. L’outil utilise les définitions isotopiques standard et les unités SI, permettant une utilisation inter-lab et une documentation reproductible.
Les cas d’utilisation incluent le suivi de l’incorporation de l’étiquette au fil du temps, la comparaison de conditions et la validation de l’activité des voies. Il se démarque en offrant un pipeline intégré de correction et de modélisation minimale adapté aux figures prêtes pour publication et à l’analyse reproductible.