15N-sporingsanalyseværktøj

Dette værktøj analyserer isotopiske tracerdata fra 15N-eksperimenter og giver korrigerede berigelsesmål og, om ønsket, simple flux-estimater. Det henvender sig til forskere inden for metabolomik, biokemi og systembiologi, der har behov for en gennemsigtig, reproducerbar analyse af isotopmærkning ved udformning eller fortolkning af tracer-eksperimenter.
Konceptuelt læser det et tabelleret datasæt, anvender en korrektion for naturlig forekomst på 15N-signaler, omdanner dem til fraktionel berigelse og grupperer resultaterne efter metabolit og tidspunkt. Når der foreligger et netværk af metabolitter via input eller antagelser, estimerer det fluxer ved hjælp af en simpel massesbalanceligning og mindste kvadraters minimering; usikkerhed kan tilnærmes via bootstrap.
Kernefunktioner omfatter dataindlæsning; 15N-korrektion; beregning af fraktionel berigelse; valgfri fluxestimering; eksportable resultater; og understøttelse af flere tidspunkter. Værktøjet bruger standard isotopdefinitioner og SI-enheder, hvilket muliggør tværlab-brug og reproducerbar dokumentation.
Anvendelsesområder inkluderer at følge mærkning over tid, sammenligne betingelser og validere veje i metaboliske stier. Det adskiller sig ved at tilbyde et integreret korrigerings- og minimal model-byggesæt, der passer til publikation-klare figurer og reproducerbare analyser.