Oligo Analyzer 3.1

Esta ferramenta analisa oligonucleotídeos usados em primers, sondas, adaptadores e bibliotecas de sequenciamento. Ela fornece propriedades-chave como temperatura de fusão, conteúdo GC, peso molecular e coeficiente de extinção para apoiar decisões de design e controle de qualidade. O fluxo aceita sequências canônicas de DNA ou RNA e parâmetros de tampão opcionais para ajustar os cálculos a condições reais.
Conceitualmente, o usuário insere a sequência e especifica o tipo de oligo; o mecanismo aplica um modelo termodinâmico de vizinhança com correções de sal para estimar Tm, calcula a porcentagem GC, deriva o peso molecular a partir dos pesos de nucleotídeos e estima o coeficiente de extinção a partir da composição de bases. Um simples indicador de risco de estrutura secundária sinaliza hairpins ou motivos repetitivos que podem afetar o desempenho. Os resultados são apresentados como valores numéricos e uma breve avaliação de risco para guiar decisões de seleção e síntese.
O valor da ferramenta reside em métricas consolidadas e reproduzíveis: uma única fonte de verdade para Tm, conteúdo GC, MW e métricas de etiquetagem para oligos de DNA e RNA. Casos de uso incluem design de primers/probes, fluxos de clonagem, configuração de qPCR e preparação de bibliotecas, onde triagem rápida e relatório padronizado aceleram o desenvolvimento e reduzem erros de pedido. Usuários avançados podem exportar relatórios CSV/JSON para integração com cadernos de design e pipelines LIMS.