VCF naar CSV-converter

De VCF-naar-CSV-converter zet VCF-variantgegevens om naar een tabel CSV-formaat, geschikt voor analyses in spreadsheets, relationele databases en BI-tools. Invoer kan via bestand upload of plaktekst. De gegenereerde CSV bevat kernvelden zoals CHROM, POS, ID, REF, ALT, QUAL, FILTER, INFO en FORMAT, met indien gewenst per-sample kolommen. Bij multi-allele records kunnen ALT-waarden in aparte rijen worden uitgebreid of als één veld blijven, afhankelijk van de configuratie. INFO-velden kunnen worden opgesplitst in afzonderlijke kolommen of als één gecodeerde kolom blijven. Geavanceerde opties ondersteunen gerichte kolomtoewijzing, volgorde van kolommen, omzetting van numerieke INFO-waarden naar getallen en eenvoudige filters om alleen records te exporteren die aan criteria voldoen. De converter voert geen variantannotatie uit; de focus ligt op formaatconversie en tabellarische bruikbare data.

Achter de schermen gebruikt de tool een robuuste streaming-parser om grote VCF-bestanden efficiënt te verwerken zonder volledig in het geheugen te laden. Het valideert de VCF-syntaxis, normaliseert numerieke waarden en zorgt voor correcte CSV-quoting. Bij INFO-extensie worden sleutel-waarde-paren geparseerd en in toegewezen kolommen geplaatst. Als uitbreiding van sample-gegevens is ingeschakeld, kunnen FORMAT/SAMPLE-velden als aparte kolommen verschijnen of weggelaten worden voor een compacte tabel. De uitvoelingsscheidingstekens kan ingesteld worden op komma of tab om TSV-compatibiliteit te waarborgen. De converter bewaart ook de header-regels uit het VCF-bestand (beginnend met #) bij export, zodat vervolgprocessen context houden.