Oligo Analyzer

Analizza sequenze oligonucleotidiche per calcolare contenuto GC, temperatura di melting e metriche di qualità per ricercatori, docenti e team biotech.

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Informazioni su questo strumento

Lo strumento idt Oligo Analyzer valuta oligonucleotidi a singolo filamento per flussi di lavoro di biologia molecolare. Si rivolge a ricercatori, clinici, educatori e team QA che progettano primer, sonde, adattatori o codici a barre. Viene utilizzato durante la revisione del design, prima della sintesi o in laboratori didattici per illustrare termodinamica e proprietà della sequenza. Lo strumento fornisce metriche quantitative, indicazioni chiare sull'idoneità e risultati esportabili per supportare la pianificazione sperimentale e la documentazione.
Lo strumento valida le sequenze di input, calcola il contenuto GC e stima la temperatura di melting utilizzando molteplici modelli termodinamici. Riporta lunghezza, GC%, Tm e flag di qualità di base. Metriche avanzate opzionali includono rischio hairpin, rischio self-dimer e potenziale cross-dimer. Gli output sono strutturati per registri di laboratorio e generazione di rapporti. Supporta una sessione sicura e i caratteri nucleotidici standard.
Lo strumento è progettato per assistere nelle revisioni di design di primer e oligo, dimostrazioni educative delle proprietà della sequenza e documentazione QA. Offre output adatti all'inclusione in appunti di laboratorio, rapporti e piani sperimentali.
Il valore unico deriva dalla combinazione di molteplici modelli termici, una chiara reportistica delle metriche e output esportabili allineati ai flussi di lavoro comuni in laboratorio, evitando istruzioni per esperimenti wet-lab.

Come usare

  1. Fornire input: incolla o carica una sequenza DNA, imposta la concentrazione salina e il modello di analisi.
  2. Seleziona le opzioni di analisi: contenuto GC, modello Tm, controlli hairpin e self-dimer.
  3. Avvia il calcolo: lo strumento calcola GC%, Tm in °C, lunghezza e punteggio di rischio.
  4. Verifica gli output: controlla le metriche, la temperatura di annealing consigliata e le opzioni di esportazione.
  5. Esporta o copia i risultati: genera CSV o copia negli appunti per registri.
How to use idt oligo analyzer tool

Frequently Asked Questions

Trova risposte rapide

Quali input sono richiesti e quali formati supporta?
È richiesta una sequenza DNA. Lo strumento accetta testo semplice o formati simili a FASTA e valida i caratteri A C G T N. La lunghezza e parametri opzionali come la concentrazione salina possono essere forniti per raffinire i calcoli.
Come viene calcolata la temperatura di melting?
Tm è calcolata con due modelli: una semplice regola di Wallace per sequenze corte e un modello a vicini con correzione salina per sequenze più lunghe. Lo strumento riporta il modello usato e la Tm risultante in Celsius.
Posso inserire RNA o oligos modificati?
Lo strumento accetta sequenze DNA per l'analisi. Se si fornisce RNA, può essere convertito in DNA in una fase di pre-trattamento. Non progetta né valuta oligos chimicamente modificati né fornisce indicazioni di sintesi.
Come posso utilizzare i risultati nei report?
I risultati includono contenuto GC, Tm, lunghezza e punteggi di rischio. Gli output possono essere esportati come CSV o copiati per inclusione in appunti di laboratorio, rapporti o piani sperimentali. Le unità sono chiaramente indicate.

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