ETE Viewer Online

Strumento online per visualizzare alberi filogenetici con ETE, consentendo a ricercatori, insegnanti e studenti di esplorare struttura e relazioni dai formati standard.

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Informazioni su questo strumento

ETE Viewer Online rende gli alberi filogenetici dai formati standard in visualizzazioni scalabili. Analizza i dati di input, costruisce un modello ad albero in memoria, applica un layout scelto e disegna una rappresentazione chiara di qualità pubblicazione.
Concettualmente, lo strumento separa l’analisi dei dati, il calcolo del layout e il rendering, consentendo visuali riproducibili per report e lezioni.
Supporta formati comuni (Newick, phyloJSON) e annotazioni come valori bootstrap, lunghezze dei rami ed etichette.
Il valore unico risiede nella combinazione di opzioni di layout, formati di esportazione e output pronti per l’automazione, adatti a pipeline.
Casi d'uso includono convalidare la topologia dell’albero, preparare figure per articoli e insegnare ecologia o concetti di evoluzione. Caratteristiche principali: input multi-formato, più layout (rettangolare, radario), personalizzazione di etichette e colori, esportazione in SVG/PNG. Progettato per ricercatori, istruttori e bioinformatici che richiedono visualizzazioni di alberi rapide e riproducibili.

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Come usare

Fornire input: dati dell’albero in formato Newick o JSON.
Scegliere formato dati e layout: rettangolare o radiale, con etichette opzionali.
Eseguire il rendering: genera un’immagine vettoriale e un esportazione bitmap opzionale.
Revisionare uscite: controllare struttura, regolare colori o annotazioni se necessario.
Esporta o condividi: scarica SVG/PNG o integra in report.

Frequently Asked Questions

Trova risposte rapide

Quali formati sono supportati?

I formati supportati includono Newick e phyloJSON per dati degli alberi, con supporto opzionale per valori bootstrap e lunghezze dei rami. Il parser gestisce variazioni comuni di sintassi e riporta errori di parsing internamente.

Posso importare alberi da banche dati esterne?

Sì. L'import supporta formati testuali (Newick, phyloJSON) e può ingerire dati basati su URL o contenuti incollati. Quando i dati esterni non sono disponibili, lo strumento passa a una modalità di rendering parse-only locale.

È adatto a grandi alberi?

Grandi alberi vengono renderizzati progressivamente con output vettoriale scalabile. La velocità di rendering dipende dalla dimensione dell'albero e dal layout; per alberi molto grandi, layout radiali e opzioni di pruning aiutano a mantenere le prestazioni.

Come vengono esportati i risultati?

Gli alberi renderizzati possono essere esportati come SVG o PNG. Esportazioni SVG preservano l’editabilità per flussi di lavoro di pubblicazione; esportazioni PNG forniscono immagini raster fisse per report o slide.

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