ETE Visualiseur en ligne

Outil en ligne pour visualiser des arbres phylogénétiques avec ETE, permettant aux chercheurs, enseignants et étudiants d'explorer structure et relations à partir de formats standard.

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À propos de cet outil

ETE Visualiseur en ligne rend les arbres phylogénétiques à partir de formats standard en visuels évolutifs. Il analyse les données d'entrée, construit un modèle d'arbre en mémoire, applique une disposition choisie et dessine une représentation claire de qualité publication.
Conceptuellement, l'outil sépare l'analyse des données, le calcul de la disposition et le rendu, permettant des visuels reproductibles pour les rapports et les cours.
Il prend en charge les formats courants (Newick, phyloJSON) et les annotations telles que les valeurs bootstrap, les longueurs de branches et les étiquettes.
Sa valeur unique réside dans la combinaison d'options de disposition, de formats d'export et de sorties prêtes pour l'automatisation destinées aux pipelines.
Les cas d'utilisation comprennent la validation de la topologie des arbres, la préparation de figures pour des articles et l'enseignement de l'écologie ou de l'évolution. Caractéristiques clés : entrée multi-format, plusieurs dispositions (rectangulaire,radial), personnalisation des étiquettes et des couleurs, export vers SVG/PNG. Conçu pour chercheurs, enseignants et bioinformaticiens nécessitant des visualisations rapides et reproductibles.

Comment utiliser

  1. Fournir les entrées : données d'arbre au format Newick ou JSON.
  2. Choisir le format et la disposition : rectangulaire ou radial, avec étiquettes facultatives.
  3. Lancer le rendu : générer une image vectorielle et une exportation bitmap optionnelle.
  4. Examiner les sorties : inspecter la structure, ajuster les couleurs ou annotations si nécessaire.
  5. Exporter ou partager : télécharger SVG/PNG ou intégrer dans des rapports.
How to use ete viewer online

Frequently Asked Questions

Trouvez des réponses rapides

Quels formats sont pris en charge?
Les formats pris en charge incluent Newick et phyloJSON pour les données d’arbres, avec prise en charge optionnelle des annotations Bootstrap et longueurs de branches. L’analyseur gère les variations syntaxiques courantes et signale les erreurs de parsing en interne.
Puis-je importer des arbres à partir de bases de données externes?
Oui. L’import prend en charge les formats textuels (Newick, phyloJSON) et peut ingérer des données basées sur des URL ou du contenu collé. En l’absence de données externes, l’outil bascule vers un mode rendu parse-only local.
Convient-il aux grands arbres?
Les grands arbres se rendent progressivement avec une sortie vectorielle évolutive. La vitesse dépend de la taille de l’arbre et du layout; pour les très grands arbres, les dispositions radial et les options d’élagage aident à maintenir les performances.
Comment les résultats sont-ils exportés?
Les arbres rendus peuvent être exportés au format SVG ou PNG. Les exports SVG préservent l’édition pour les workflows de publication; les PNG offrent des images raster fixes pour les rapports ou presentations.

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