כלי מיזוג GFF3

כלי המיזוג GFF3 מאחד מספר קבצי הערות למקה נתונים GFF3 מאוחד. הוא מקבל אחד או יותר קבצי GFF3 בטקסט נקי, כפוף לדחיסה gz אם נדרש, ומפיק קובץ GFF3 יחיד ותואם לניתוחים בהמשך. נתוני הליבה (seqid, source, type, start, end, score, strand, phase) וכל העמודות של תכונות יישמרו, כאשר התנגשות ועותקים יפתרו באופן דטרמיניסטי.
היגיון ופלט: המנוע מפרש כל תכונה, מחלק לפי שדות מפתח וממזג רשומות לפי מדיניות מוגדרת. תכונות זהות עם תכונות משותפות אך שונות ימוזגו את התכונות הלא-קונפליקטיות; ערכים סותרים ניתן ללוג ולטפל לפי כללי משתמש. הפלט המעורב ממויין לפי seqid, התחלה וסוף, תוך שמירה על שורות הכותרת.
מי מרוויח ומהם היתרונות: מדענים הבונים מאגרי נתונים בין-מדעיים, צוותי בקרה על הערות ומהנדסי ביואינפורמטיקה שמפתחים pipelines שחוזרים על עצמם נהנים מתהליך מיזוג אמין ומאובטח. תכונות ייחודיות כוללות אימות GFF3 קפדני, יומני מיזוג שקופים, מסננים (לאחר סדרת, סוג או מקור) ודו"חות שינויים המסייעות לשרשור והaudits. דוגמאות שימוש: אינטגרציה של הערות ממערכים שונים, ריכוז קטלוג תכונות והכנת נתונים לגנומיקה השוואתית. המערכת מכוונת ליציבות נתונים, תוצאות דטרמיניסטיות והתאמה לסטנדרטים של GFF3 כדי להפחית טעויות לאחר העיבוד.