Calculateur de Pooling

Outil en ligne simple pour calculer les pools optimaux d’échantillons pour le séquençage Illumina, permettant d’économiser et d’améliorer l’efficacité.

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À propos de cet outil

Ce calculateur de pooling s’adresse aux chercheurs génomiques et professionnels de la biotech réalisant du séquençage Illumina. En saisissant des paramètres tels que le nombre total d’échantillons, la plateforme choisie, la profondeur de couverture souhaitée et les limites de multiplexage, les utilisateurs obtiennent des stratégies de regroupement optimisées pour une meilleure utilisation des ressources. L’outil simplifie les calculs complexes liés à la conception de pools, prenant en compte les caractéristiques et contraintes propres à chaque plateforme. Il permet des décisions rapides, une estimation des coûts et une planification pour des projets génomiques à grande échelle. Des options avancées incluent la prise en compte de la taille des fragments d’ADN et des risques comme le hopping d’index, fournissant des insights détaillés pour un déploiement efficace. Que vous gériez de petits ou grands groupes d’échantillons, cet outil garantit un pooling précis et efficace — gagnant du temps, réduisant les coûts et améliorant la qualité des données.

Connectez-vous pour voir toute votre utilisation

Comment utiliser

1. Entrer le nombre total d’échantillons à séquencer.
2. Sélectionner votre plateforme Illumina dans le menu déroulant.
3. Saisir la profondeur de coverage désirée par échantillon.
4. Indiquer la limite de multiplexage par run.
5. Optionnel : ajuster la taille des fragments d’ADN si nécessaire.
6. Cliquer sur 'Calculer' pour voir les détails de pooling optimisés.

FAQ/Ressources supplémentaires

Trouvez des réponses rapides

Qu’est-ce que le pooling d’échantillons en séquençage Illumina?

Comment ce calculateur optimise-t-il les stratégies de pooling?

Puis-je ajuster les paramètres pour différentes tailles de fragments d’ADN?

Le calculateur donne-t-il une estimation du coût de la séquence?

Cet outil est-il adapté à des projets petits ou grands?

Avis des utilisateurs

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