Oligo Analyzer 3.1

Esta herramienta analiza oligonucleótidos utilizados en primers, sondas, adaptadores y bibliotecas de secuenciación. Proporciona propiedades clave como temperatura de fusión, contenido GC, peso molecular y coeficiente de extinción para apoyar decisiones de diseño y control de calidad. El flujo acepta secuencias canónicas de ADN o ARN y parámetros de búfer opcionales para adaptar los cálculos a condiciones reales.
Conceptualmente, el usuario introduce la secuencia y especifica el tipo de oligo; el motor aplica un modelo termodinámico de vecinos con correcciones de sal para estimar Tm, calcula el porcentaje GC, deriva el peso molecular a partir de los pesos de los nucleótidos y estima el coeficiente de extinción a partir de la composición de bases. Una simple indicador de riesgo de estructura secundaria señala posibles mechones o motivos repetitivos que pueden afectar el rendimiento. Los resultados se presentan como valores numéricos más una breve evaluación de riesgo para guiar decisiones de selección y sintesis.
El valor de la herramienta radica en métricas consolidadas y reproducibles: una única fuente de verdad para Tm, GC, MW y métricas de etiquetado en oligos de ADN y ARN. Casos de uso incluyen diseño de primers/probes, flujos de clonación, configuración de qPCR y preparación de bibliotecas, donde el cribado rápido y la generación de informes estandarizados aceleran el desarrollo y reducen errores de pedido. Usuarios avanzados pueden exportar informes CSV/JSON para integrarlos con cuadernos de diseño y pipelines LIMS.