تحسين الكودونات

هذه الأداة تقبل تسلسلاً DNA مشفّراً ومضيفاً مستهدفاً كمدخلات وتعيد سلسلة محسّنة تتوافق مع استخدام الكودونات لدى المضيف. كما توفر دفتر استبدالات وتقييم موجز يساعد في تقييم قابلية التعبير والإمكانية التخطيطية للسِنْتْسِة. المخرجات مناسبة لتدفقات العمل الخاصة بالاستنساخ والتخليق الجيني.
يقوم النظام بتعيين كل موضع أميني إلى كودون مفضل بناءً على جدول استخدام المضيف مع تطبيق قيود مثل نطاق GC وتلافي الأنماط. يحسب درجة تعبير ويُسجل الاستبدالات بما يتيح إمكانية التكرار والتوثيق عبر دورات التصميم.
العلماء الذين يصممون تراكيب لـ E. coli أو فطر Yeast أو خلايا الثديات سيستفيدون من دورات تصميم أسرع وزيادة الثقة في نتائج التعبير. يتميز الأداة بتقييم يعتمد على الانحياز، قيود قابلة للتكوين، معالجة دفعات وتقارير شفافة يمكن تصديرها إلى تنسيقات قياسية.
التحقق من المدخلات، دعم جداول كودونات المضيف، جداول مخصصة اختيارية، ضوابط GC، تصفية الأنماط، وضع دفعات، خريطة لكل كودون والتصدير في FASTA وCSV تدعم مسارات العمل الشائعة لتحسين تعبير جين مُشفَّر في مضيف غير أصلي أو إعداد تراكيب لسلاسل التخليق عالية الإنتاجية.