Conversor VCF para CSV

Converte dados de variantes VCF para CSV, permitindo que pesquisadores e analistas verifiquem, filtrem e exportem informações de variantes em planilhas.

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About This Tool

O Conversor VCF-CSV transforma dados de variantes VCF em um formato CSV tabular, adequado para análises em planilhas, bases de dados e ferramentas BI. A entrada pode ocorrer via upload de arquivo VCF ou colagem de texto VCF, e o CSV gerado inclui campos-chave como CHROM, POS, ID, REF, ALT, QUAL, FILTER, INFO e FORMAT, com colunas opcionais por amostra. Para registros multi-álelos, ALT pode ser expandido para linhas separadas ou mantido em um único campo, conforme configuração. Campos INFO podem ser expandidos em colunas separadas ou mantidos como uma coluna codificada. Opções avançadas permitem mapeamento de colunas, ordem de colunas CSV, conversão de valores INFO numéricos e filtros simples para incluir apenas registros que atendam a critérios. O conversor não realiza anotação de variantes; o objetivo é a conversão de formato e dados prontos para planilhas.

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How to Use

Carregue um arquivo VCF ou cole o texto VCF.
Selecione opções: ALT multi-álelos em linhas separadas; expandir chaves INFO em colunas; expandir FORMAT/SAMPLE; escolher o delimitador.
Inicie a conversão para gerar CSV.
Verifique a visualização do CSV e faça o download.
Valide um subconjunto de linhas e use o CSV exportado em análises subsequentes.

Frequently Asked Questions

Find Quick Answers

Quais formatos de entrada são suportados?

Entradas VCF de texto padrão não comprimidas por upload de arquivo ou colagem. Formatos comprimidos como .vcf.gz não são suportados nesta versão; use VCF não comprimido para a conversão.

Posso expandir campos INFO?

Sim; você pode expandir chaves INFO selecionadas para colunas CSV separadas ou manter uma única coluna INFO. O mapeamento é configurável por execução e pode ser salvo como preset.

Como são tratados registros multi-álelo?

Valores ALT podem ser expandidos em linhas separadas ou mantidos em um único campo, conforme a configuração. Mantém o alinhamento com CHROM e POS e disponibiliza dados ALT conforme necessidade.

Existem limites de desempenho para grandes arquivos VCF?

O analisador utiliza processamento em streaming para limitar o uso de memória e lidar com grandes arquivos. Para conjuntos muito grandes, considere uploads em blocos ou fluxos de trabalho baseados em scripts para monitorar progresso e memória.

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